A Libertadores 2006 foi a libertação de sofrimentos de anos sem esse titulo. A competição mais desejada das Américas veio depois de termos nos classificado em segundo, devido o roubo do titulo brasileiro de 2005. Uma Copa cheia de times tradicionais ficou ao final nas mãos do Inter, depois de enfrentarmos um grupo com Pumas, Maracaibo e Nacional do Uruguai e sairmos em primeiro para os mata matas.
Nas Oitavas pegamos novamente o Nacional, atual campeão uruguaio e tri campeão da América, ganhamos no uruguai dando um balde de água fria nos nossos rivais uruguaios e empatando e eliminando eles na nossa casa.
Nas Quartas pegamos a LDU, base da seleção equatoriana, atual campeã do apertura do equador e que dois anos depois seria campeã da América. Levariamos nossa única derrota no equador, mas no Beira Rio com muita raça ganhamos e passamos para as semis.
Nas Semis pegamos o Libertad, que uns dias antes foi campeão do apertura paraguaio e era um time muito dificil que inclusive eliminou o River Plate. Empatamos no Paraguai e ganhamos no Beira Rio, estávamos prontos para a grande final.
Na grande final pegamos o campeão Mundial e continental São Paulo, do professor Muricy. Ganhamos dentro do Morumbi lotado e empatamos em casa para conseguirmos a Glória Eterna, um título histórico e inigualável para todo Colorado. Obrigado Fernandão!



